乳腺癌易感基因 1 和 2(BRCA1 和 BRCA2)編碼的蛋白質(zhì)起著腫瘤抑制因子的作用,以維持基因組穩(wěn)定性。BRCA1/2 基因突變可導(dǎo)致 DNA 損傷,顯著增加罹患各種癌癥的風(fēng)險(xiǎn),尤其是乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌和胰腺癌。BRCA1 和 BRCA2 的致病突變分別使乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)增加 7.6 倍或 5.2 倍。1雖然普通人群中乳腺癌和卵巢癌的終生風(fēng)險(xiǎn)分別為 12% 和 1.3%,但 BRCA1 突變攜帶者的累積終生風(fēng)險(xiǎn)分別為 72% 和 44%,BRCA2 突變攜帶者的累積終生風(fēng)險(xiǎn)分別為 69% 和 17% 。2
臨床研究表明,BRCA1/2 基因突變與多種癌癥對(duì)聚 ADP 核糖聚合酶 (PARP) 抑制劑的敏感性有關(guān)。3-6美國(guó) 食品藥品監(jiān)督管理局 (FDA) 已批準(zhǔn)四種 PARP 抑制劑作為乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌或胰腺癌 BRCA1/2 突變患者的單一療法或維持療法:奧拉帕尼、魯卡帕尼、尼拉帕尼和他拉唑帕尼。7因此,準(zhǔn)確檢測(cè) BRCA1/2 突變對(duì)疾病的臨床管理(包括是否適合接受 PARP 抑制劑治療)具有巨大影響。
BRCA1/2 突變可以是單核苷酸變異 (SNV)、小插入/缺失 (INDEL) 或大基因組重排 (LGR),后者被定義為涉及一個(gè)或多個(gè)外顯子的很大一部分的缺失或插入。LGR 占 BRCA1 致病突變的 27% 和 BRCA2 致病突變的 5%,在某些人群中,強(qiáng)大的奠基者效應(yīng)占所有癌癥診斷的約 1/ 3。8
可以使用基于下一代測(cè)序 (NGS) 或聚合酶鏈反應(yīng) (PCR) 的方法檢測(cè) BRCA1/2 中的 SNV 和小 INDEL 突變。然而,PCR 受限于低復(fù)雜性和僅能檢測(cè)已知的 BRCA1/2 突變。雖然廣泛使用的短讀 NGS 面板方法能夠高通量檢測(cè) BRCA1/2 中的所有可能突變,但如果不對(duì)測(cè)序流程進(jìn)行額外修改,通常無(wú)法檢測(cè) LGR。因此,在使用基于 PCR 的方法或 NGS 面板(當(dāng)前診斷市場(chǎng)上使用廣泛的兩種技術(shù))進(jìn)行分子篩選時(shí),BRCA1/2 LGR 經(jīng)常被遺漏。因此,BRCA1/2 LGR 的檢測(cè)主要依賴于替代的 NGS 獨(dú)立檢測(cè),例如多重連接依賴性探針擴(kuò)增 (MLPA)、微陣列或全基因組/外顯子測(cè)序,從而導(dǎo)致成本增加和周轉(zhuǎn)時(shí)間延長(zhǎng)。9
理想情況下,一次 BRCA1/2 檢測(cè)應(yīng)能同時(shí)檢測(cè)所有突變,以幫助指導(dǎo)癌癥患者管理中的循證臨床決策。在所有可用方法中,NGS 面板可以作為選擇測(cè)試,當(dāng)在生物信息學(xué)流程和/或面板設(shè)計(jì)中納入某些調(diào)整以實(shí)現(xiàn)拷貝數(shù)檢測(cè)時(shí)。在進(jìn)行流程調(diào)整后,需要進(jìn)行驗(yàn)證過(guò)程以證明除了 SNV 和小 INDEL 之外檢測(cè) LGR 的有效性。由于含有 LGR 的臨床樣本稀缺,因此,正如診斷界所推薦的那樣,特征明確且類似于患者的參考材料是難以獲取的臨床樣本的理想替代品,用于評(píng)估流程的靈敏度和特異性。10
LGC Clinical Diagnostics 開(kāi)發(fā)了一套的 BRCA1/2 LGR 參考材料,以支持行業(yè)開(kāi)發(fā)和驗(yàn)證 BRCA1/2 LGR NGS 面板的需求。Seraseq ® BRCA1/2 LGR 參考材料和突變混合物以兩種格式提供:
Seraseq ® FFPE BRCA1/2 LGR 參考材料為腫瘤 BRCA 檢測(cè)提供了從 DNA 提取開(kāi)始的全過(guò)程控制。
Seraseq ® gDNA BRCA1/2 LGR 體細(xì)胞/遺傳突變混合物以純化的 DNA 形式提供,其等位基因頻率適合體細(xì)胞或種系測(cè)試,可直接用于文庫(kù)制備。
這些 BRCA1/2 參考材料均包括 BRCA1 和 BRCA2 基因中的 10 種變異,大小從 SNV 到 500 bp 以上的 INDEL 不等,涵蓋各種變異類型,為驗(yàn)證過(guò)程提供足夠的挑戰(zhàn)。點(diǎn)擊此處或以下按鈕查看我們的產(chǎn)品表:
特點(diǎn)和優(yōu)點(diǎn)
使用包含對(duì) BRCA 驅(qū)動(dòng)的癌癥很重要的生物標(biāo)志物的高度多路復(fù)用的參考材料,自信地開(kāi)發(fā)、監(jiān)控、驗(yàn)證和挑戰(zhàn)基于混合捕獲的靶向 NGS 檢測(cè)。
單個(gè)樣本含有 20 個(gè)致病性 BRCA1/2 變異(11 個(gè) LGR、9 個(gè)缺失、5 個(gè) SNV、4 個(gè)插入缺失和 2 個(gè)插入)。
通過(guò)高靈敏度的 dPCR 檢測(cè)定量突變目標(biāo),并通過(guò) NGS 進(jìn)行正交分析。
所有突變均與已充分表征的 GM24385 人類基因組 DNA 混合作為“野生型"背景材料。
可用作全過(guò)程(FFPE curl)或純化的基因組 DNA,具有適合體細(xì)胞或種系測(cè)試的各種等位基因頻率。
在符合 GMP 和 ISO 13485 認(rèn)證的工廠生產(chǎn)。
北京和一生物科技有限公司專業(yè)代理antibodiesinc全系列產(chǎn)品,專營(yíng)進(jìn)口生物試劑,科學(xué)儀器,實(shí)驗(yàn)消耗品,化工原料及藥物中間體等。公司與諸多國(guó)外品牌簽下代理,sigma、santa、RD、Abcam、CST、toxin、streck、Biolegend、ebioscience、saracare、polyplus、Beyotime、Novus、moltox等,能為廣大科研用戶提供數(shù)萬(wàn)種試劑、儀器和實(shí)驗(yàn)消耗品。
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