技術簡介
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是蛋白質-DNA互作關系研究的新方法,是新一代超微量ChIP-Seq技術,適用于無ChIP級別抗體的蛋白研究。與傳統的ChIP-Seq研究方法相比,該技術無需交聯、超聲打斷、末端抹平和接頭連接等操作,因此具有省時高 效、所需的樣品量少、背景信號低和可重復性好等優點,甚至可用于單細胞水平測序。CUT&Tag有望將蛋白質-DNA互作的研究變成一種類似PCR反應的常規操作,對基因調控、表觀遺傳等領域的研究具有革命性的意義。
產品優勢
樣品起始量低:能夠對及少量樣品進行分析
無需ChIP級別抗體:無需提供ChIP級別抗體
性價比高:背景噪音低,所需測序深度少
實驗重復性好:實驗重復結果一致性好
技術原理
ChiTag是Protein AG蛋白與Tn5轉座酶的融合蛋白,當抗體結合目的蛋白(如轉錄因子、組蛋白等)后,Protein AG蛋白可直接結合抗體,攜帶的Tn5轉座酶可特異性的切割目的蛋白附近的DNA pian段,并將DNA pian段連上接頭,文庫構建之后可進行高通量測序。
圖注: CUT&Tag實驗流程
案例解析
CUT&Tag技術研究蛋白質-DNA互作的優勢
原文:CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells
期刊:Nature Communications 發表時間:20190429 影響因子: 11.878
在生物學研究中,DNA與蛋白質之間的互作是至關重要的,參與基因的表達、調控、復制、重組和修復以及RNA的轉運、翻譯和調控等多個過程,幾乎涉及所有的生命活動。目前研究兩者互作的方法很多,作者選擇了傳統的研究手段ChIP-seq,優化的CUT&RUN方法,以及新方法CUT&Tag共同研究組蛋白H3K27me3。通過比對實驗結果,發現CUT&Tag有*低的背景噪聲以及zui強的信號。通過對H3K4me1修飾物進行分析,顯示CUT&Tag的靈敏度*高,實驗可重復性*好。
圖注. CUT&Tag方法的優點
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產品名稱 | 貨號 | 規格 | 品牌 |
CUTANA™ pAG-Tn5 for CUT&Tag | 15-1017 | 50reactions | Epicypher |
Anti-Mouse Secondary Antibody for CUTANA™ CUT&Tag Workflows | 13-0048 | 250reactions | Epicypher |
Anti-Rabbit Secondary Antibody for CUTANA™ CUT&Tag Workflows | 13-0047 | 250reactions | Epicypher |
CUTANA™ Rabbit IgG CUT&RUN Negative Control Antibody | 13-0042 | 100µg | Epicypher |
Histone H3K4me3 Antibody: SNAP-ChIP® Certified, CUTANA™ CUT&RUN Compatible | 13-0041 | 100µg | Epicypher |
CUTANA™ E. coli Spike-in DNA | 18-1401 | 100ng | Epicypher |